Sentieon DNA background

Sentieon Logo Sentieon 基因分析加速软件

Enabling Precision Data for Precision Medicine

Sentieon软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2金标准的数学模型, 在保证完全匹配GATK/BWA结果的前提下,计算效率提升15倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案, 可同时处理10万个WGS样本的joint calling,无需中间步骤。大幅提升WGS/WES/Panle/ctDNA/RNA等基因数据分析效率。

Sentieon介绍

Sentieon 致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈,通过算法的深度优化和企业级的软件工程,大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。

Sentieon为来自分子诊断、药物研发、临床医疗、动植物研究等多个领域的合作伙伴和科研机构提供软件解决方案,共同推动基因技术的发展,实现“成就精准数据,服务精准医疗“的愿景。

毅硕科技(INSVAST)作为Sentieon Inc. 大中华区授权服务机构,我们将始终本着真诚的态度 and 专业的精神,坚持并维护Sentieon Inc. 愿景,为大中华区客户提供优质的服务。

解决方案

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Sentieon为完整的纯软件二次分析解决方案,该方案涵盖了从基因比对到变异检测的全部流程,可同时用于胚系突变检测和体细胞突变检测。全面支持主流二、三代测序平台,包括 illumina、MGI、PacBio、Nanopore、Genemind、IonTorrent、Ultima、Element等。
Sentieon软件为NGS二级分析用户提供完整的全流程的计算模块。得益于高度灵活的模块化架构,Sentieon既支持标准化 Pipeline 运行,也允许用户根据特异性的项目需求,单独调用特定模块去替换原流程中的模块,实现算力的极致加速与无损升级。

Sentieon软件针对不同的应用场景,创建了成熟的的pipeline流程,包括用于胚系比变异检测的DNAseq、DNAscope;用于体细胞变异检测的TNseq、TNscope;适合大群体队列分析的Joint Calling;前沿的泛基因组分析流程;处理二代、三代数据的混合分析DNAscope Hybrid流程;专门针对三代测序数据的DNAscope LongRead分析流程等。满足不同用户的需求。

Sentieon主要流程

Sentieon® 为 DNA/RNA 数据提供完整的解决方案,其软件可部署于任何通用的基于 CPU 的计算系统。我们的软件对 BWA、STAR 和 Minimap2 比对工具进行了改进,在显著提升比对速度的同时,能够生成完全一致的输出结果。通过使用测序平台特异性的模型文件,软件支持从二代和三代测序数据中进行生殖细胞系与体细胞的 SNV、Indel、SV 和 CNV 变异检测,并具备屡获殊荣的准确度。

通过模块化的软件组件,软件还涵盖了 UMI 分子标签共识序列生成、大规模联合基因分型、CRISPR 分析、质量控制以及 BAM 预处理功能。我们的产品已通过客户的广泛测试与验证,成功处理了数百万份样本,处理的序列数据总量已超过 3000 Pb。

以下是Sentieon软件的主要流程,了解更多流程,可点击此处进行查看

Sentieon软件为从BWA、GATK、MuTect、MuTect2、Picard切换到Sentieon运行环境的用户,提供了完善的无缝的脚本和示例供用户使用,为方便用户进行在线学习,我们提供完整的Sentieon快速入门指南、技术文档等

Sentieon软件兼容性

在基因计算领域,由于GATK是针对x86指令集开发的,使用未经ARM优化的GATK在ARM处理器上的运行速度会显著降低,这使得基因行业难以充分利用ARM处理器的高性价比优势。为此,Sentieon对所有软件模块进行了深度的ARM指令集优化与性能评测。

2019年11月,我们正式推出了Sentieon Genomics for ARM软件包,全面支持包括AWS Graviton、华为鲲鹏920、AMPERE Altra及阿里云ARM方案在内的ARMv8架构处理器。

在确保计算结果与x86平台完全一致的前提下,进一步降低了30%以上的计算成本。目前,Sentieon已实现从云端、超算中心到本地服务器的X86与ARM架构全面兼容。

Sentieon 奖项

Sentieon 2015年正式推出软件产品以来,多次赢得国际生信大赛的第一名,获得从速度到精度的全方位认可。

通过与行业的逐步融合,Sentieon的工具包一直在为生信一线的用户提供高效可靠的数据分析支撑。

右下方查看Sentieon获奖项目

Sentieon PrecisionFDA Truth Challenge V2 获奖
Sentieon Bio-IT World 和 DREAM Challenges 获奖
01
荣获最佳综合性能奖及最高重现性奖precisionFDA Consistency Challenge (Germline)点击查看
02
荣获最高 INDEL 精准度奖及最高 SNP 召回率奖precisionFDA Truth Challenge (Germline)点击查看
03
荣获所有类别第一名:SNV、INDEL 和 SVICGC-TCGA Dream Mutation Calling Challenge (Tumor/Normal)点击查看
04
冠军及各项指标最佳表现者precisionFDA VHA Innovation Ecosystem and precisionFDA COVID-19 Risk Factor Modeling Challenge点击查看
05
因完美表现被授予“变异捕手”与“VAF 侦查员”称号precisionFDA Hidden Treasures Warm-up (WES)点击查看
06
综合表现最佳者,并在全部三个子挑战赛中均位列第一名precisionFDA Brain Cancer Predictive Modeling and Biomarker Discovery Challenge点击查看
07
所用方法在子挑战 1 和子挑战 2 中均位列第一名precisionFDA NCI-CPTAC Multi-omics Enabled Sample Mislabeling Correction Challenge (Multi-omics)点击查看
08
荣获 Bio-IT 创新实践奖(BWA/GATK 的即插即用型替代方案)Bio-IT Innovative Practices Award - Sentieon® DNAseq® and TNseq® software tools for NGS data processing点击查看
09
荣获最多类别冠军:全基准区域-多平台组合、难图谱区域-PacBio、MHC 区域-PacBio 及 MHC-多平台组合precisionFDA Truth Challenge V2: Calling Variants from Short and Long Reads in Difficult-to-Map Regions点击查看

Sentieon用户分布

截至2026年4月份,Sentieon已经在全球范围内为1860+用户提供服务,处理超过7400+PB数据量,被世界一级影响因子刊物如NEJM、Cell、Nature等广泛引用,引用次数超过1900篇。此外,Sentieon连续数年摘得了Precision FDA、Dream Challenges等多个权威评比的桂冠,在业内获得广泛认可。

pie_chartAccumulated Core Hours
1,007,761,389+
groupsTrusted By Clients
1,860+
account_balanceTotal Datasets Processed
4,976,999+
menu_bookCitation Count
1900+
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